Bütçe ve Tahakkuk Şubesi Müdürlüğünün görevleri şunlardır:
a) Genel Müdürlüğün yıllık bütçesini hazırlamak ve Maliye Bakanlığı nezdinde takibini yapmak,
b) Bakanlık merkez ve taşra personelinin yan ödeme cetvellerini hazırlanmak ve Strateji Geliştirme Başkanlığınca onaylanmasından sonra merkez ve taşraya dağıtım işlemlerini yürütmek,
c) 657 sayılı Devlet Memurları Kanununun 78 ve 79 uncu maddeleriyle, Yetiştirilmek Amacıyla Yurtdışına Gönderilecek Devlet Memurları Hakkında Yönetmelik ve Kaymakam Adayları Yönetmeliği gereğince yurtdışına gönderilen Kaymakam Adaylarının; yurtdışı maaşları, yurtdışı yollukları, eğitim giderleri, uçak biletleri rezervasyonu gibi iş ve işlemleri yürütmek,
ç) Genel Müdürlük personelinin maaşlarını ve fazla mesai ücretlerini ödemek,
d) Bakanlık merkez ve taşra teşkilatı personelinin maaş ve sosyal hakları ile ilgili (mukayese maaş) bilgilerini hazırlamak,
e) Genel Müdürlük personelinin yurtdışı ve yurtiçi tedavi (hastane ve eczane) ve cenaze giderlerini ödemek,
f) Genel Müdürlüğün ihtiyacı bulunan kırtasiye ve büro malzemesinin alımının yapılması, dağıtılması ve takibini yapmak,
g) Genel Müdürlüğün demirbaş malzemesi alımı, bakım ve onarımının yaptırılması iş ve işlemlerini yürütmek,
ğ) Genel Müdürlüğe yeni telefon aboneliğini yaptırmak ve aylık faturalarını ödemek,
h) Yurtdışı ve yurtiçi geçici görev yolluklarını ödemek,
ı) Yurtiçi ve sürekli görev yolluklarını ödemek,
i) Yurtdışı eğitiminden erken dönen Kaymakam Adayları ile ay içinde Genel Müdürlükten çeşitli nedenlerle ayrılan personele kişi borcu çıkartılması ile ilgili işlemleri yürütmek,
j) Şube görev alanına giren, Bakanlık aleyhine açılan davalarla ilgili Hukuk Müşavirliğinden gelen yazılara savunma hazırlamak,
k) İlgili mevzuat hükümleri esas alınarak yıl içerisinde yapılan ödemelerle ilgili, Nakit Talebi İşlemlerinin, Ayrıntılı Harcama Programının, Kesin Hesap Cetvelinin, Kurumsal Mali Durum ve Beklenti Raporu İle Bütçe Gideri Tablosunu hazırlamak,
l) Naklen başka kuruma veya Bakanlık birimlerine geçen personelin, personel nakil bildiriminin düzenlenmesi ve Merkez Saymanlık kanalıyla Genel Müdürlüğümüzden ilişiğinin kesilmesi işlemlerini gerçekleştirmek,
m) Şube görev alanı ile ilgili mevzuatın hazırlanması, uygulamaya konulması ve değişikliklerin yapılması ile ilgili çalışmaları yürütmek ve uygulanmasını sağlamak,
n) Genel Müdürlük Makamınca verilen iş ve işlemleri yürütmek.