Görevleri
a) Genel Müdür adına Kontrolörler Başkanlığını yönetmek, kontrolörlerin çalışmalarını düzenlemek ve denetlemek,
b) Yıllık çalışma ve teftiş programlarını hazırlamak, onaya sunmak ve uygulanmasını izlemek,
c) Bakan ve Genel Müdürün teftiş, denetim, inceleme, soruşturma ve araştırma emirleri üzerine kontrolörleri görevlendirmek ve sonucunu izlemek,
ç) Kontrolörlerin düzenledikleri teftiş rapor ve layihalarını inceleyerek mevzuata aykırı tenkit ve tavsiyeler görüldüğü takdirde gerekli düzeltmeyi yaptırmak,
d) Soruşturma, denetim, ön inceleme ve araştırma raporlarını inceleyerek, varsa eksiklik ve noksanlıkların düzeltilip tamamlatılması ve ilgili yerlere gönderilmesini sağlamak,
e) Kontrolörler Başkanlığı personelinin maaş ve diğer özlük hakları ile ilgili işlemleri yürütmek,
f) Kontrolörler Başkanlığı personelinin yurtiçi, yurtdışı ve sürekli görev yolluğu ile ilgili iş ve işlemleri yürütmek,
g) Yılı içerisinde kontrolörler tarafından yapılan; soruşturma, denetim, ön inceleme ve araştırma raporlarının özetini ihtiva eden bir genel rapor hazırlamak,
ğ) Arşivleme ve diğer görevleri yapmak,
h) Açılan davalarla ilgili savunmaya esas olmak üzere verilen süre içinde cevap hazırlamak,
ı) Kontrolörler Başkanlığının görev alanına giren konularla ilgili yazılı ve sözlü soru önergeleri ile bilgi edinme ve diğer başvuruları cevaplandırmak,
i) Kontrolörler Başkanlığında iç kontrol sisteminin etkin bir şekilde işlemesini sağlayacak tedbirleri almak ve stratejik planlamayla ilgili iş ve işlemleri yapmak,
j) Kontrolörler Başkanlığının görev alanına giren konularla ilgili ihtiyaç duyulan mevzuat düzenlemelerine ilişkin çalışmaları yürütmek ve bu konulara ilişkin görüş bildirmek,
k) Standart dosya planı dâhilinde şubenin yazışmalarına ilişkin evrak kayıt, dağıtım, dosyalama, gönderme ve arşivleme iş ve işlemlerini yürütmek,
l) Genel Müdür tarafından verilen diğer görevleri yapmak.